Martwisz się o zaprojektowanie kladogramu ze stołu? Oto kilku twórców kladogramów, którzy mogą bardzo pomóc.
Kiedy byliśmy dziećmi, wszyscy czytaliśmy w Biologii, że wszyscy są ze sobą w jakiś sposób spokrewnieni, na przykład małpy są przodkami ludzi, jesteśmy związani z łańcuchem pokarmowym i wiele innych.
Drzewo kladogramu reprezentuje relacje przodków między organizmami oparte na sekwencjach DNA, cechach fizycznych i fenotypach. Jest to drzewo ewolucyjne, które pozwala kategoryzować każdy klad na podstawie podobnych cech, narracji ewolucyjnych i adaptacji. Najbardziej prawdopodobną hipotezę ustala się na podstawie porównanych i narysowanych kladogramów.
Wykorzystuje linie do reprezentowania kierunków kladu z innymi przodkami lub grupami organizmów. Można łatwo prześledzić linie do początkowego i końcowego kladu reprezentującego hipotetycznych przodków.
W razie potrzeby organizmy dzieli się na podstawie poziomu molekularnego i morfologicznego przy użyciu danych behawioralnych (dla zwierząt). Algorytmy generowania kladogramu służą do wykonywania zadań optymalizacyjnych na podstawie danych wejściowych. Celem jest rozwiązanie problemu minimum globalnego, preferowane jest podejście symulowanego wyżarzania, które zapewnia znalezienie optymalnego rozwiązania.
Mając to na uwadze, oto lista narzędzi kladogramu, które można wybrać.
Spis treści:
Twórczy
Łatwo wizualizuj relacje z Twórczy Twórca kladogramu do reprezentowania związku między gatunkami. Twórczo pomaga skutecznie identyfikować i wizualizować relacje filogenetyczne. Jest to świetny sposób na przedstawienie różnych gatunków biologicznych z takimi cechami jak:
- Obrazy PDF, SVG i PNG do wyeksportowania do drukowania i udostępniania
- Wiele szablonów dla diagramu filogenetycznego i kladogramu
- Łatwa wizualizacja relacji na płótnie
Oferuje rozbudowane biblioteki kształtów, w tym klucze dychotomiczne, sieci pokarmowe, drzewa filogenetyczne i wiele szablonów do grupowania organizmów. Narzędzie zapewnia proste funkcje przeciągania i upuszczania, aby bez wysiłku tworzyć relacje dzięki zaawansowanemu formatowaniu tekstu i konfigurowalnym motywom kolorystycznym.
Kreatywnie oferuje obrazy zwierząt typu „przeciągnij i upuść” oraz dynamiczne złącza, aby płynnie rozwijać, obracać i zmieniać rozmiar diagramów. Twórz dynamiczne kladogramy z wbudowanymi obrazami Google, aby scentralizować dane badawcze wypełnione nieskończonym płótnem, uniwersalnym wyszukiwaniem pełnotekstowym, wbudowanymi narzędziami i wszechstronną tabelą.
Łatwo jest współpracować z innymi przy użyciu kursorów w czasie rzeczywistym, sekcji komentarzy do dyskusji i wideokonferencji.
Kreator wglądu
Kreator wglądu to uproszczona forma budowania modeli w przeglądarkach internetowych. Można łatwo tworzyć schematy pętli i bogate obrazy, tworząc symulacje dla dowolnych wymagań za pomocą Insight Maker. Pomaga w szybkim stymulowaniu interakcji populacyjnych i określa zachowanie agenta.
Insight Maker jest łatwy w użyciu:
- Uruchom narzędzie w przeglądarce internetowej bez żadnych wtyczek ani pobierania
- Umieść swoje pomysły na płótnie, aby tworzyć modele symulacyjne, bogate zdjęcia i spostrzeżenia
- Użyj algorytmów symulacji, aby rozpocząć modelowanie oparte na agentach i dynamiczne modelowanie systemu
- Współpracuj z zespołem i pozwól im przesłać Ci również wkład w projekty
- Twórz modele za darmo i wykorzystaj moc kreatywności
Ponadto użytkownicy mogą wpaść na pomysł w kladogramach i sprawdzić, nad czym pracują inni. Pomoże im przeprowadzić burzę mózgów i znaleźć najlepsze rozwiązanie.
Guliford
Używaj SimpleClade z Guliford wymyślić idealną analizę kladystyczną. Oferuje graficzny interfejs użytkownika do projektowania prostej metody pracy w klasie paleontologii. Oprócz tego narzędzie jest łatwe w użyciu, instaluje oprogramowanie i natychmiast zaczyna z niego korzystać.
Użytkownicy mogą utworzyć plik danych CSV i rozpocząć generowanie kladów. Cały proces użytkowania komórki zawiera w sobie wartość różnicującą, której można się szybko nauczyć. Użytkownicy mogą oznaczyć klad „NIEUŻYWANY”, którego nie używają i wprowadzić wartość innych kladów.
Użytkownicy mogą zacząć od operacji programu i wybrać węzły, które mogą wyjaśnić ich zapytanie, w razie potrzeby zmienić połączenie, obliczyć statystyki oszczędnościowe, połączyć poziome rdzeń dla grupy obcej i wyświetlić zmianę stanu cechy.
IUBio
IUBio to kolejne popularne narzędzie używane do tworzenia kladogramów, eurogramów, swoopogramów, krzywizn, fenogramów i diagramów drzew. Jest łatwy w użyciu, prześlij plik drzewa (lub wklej adres URL), podaj tytuł i prześlij szczegóły.
Użytkownicy mogą również wybrać dodatkowe opcje w IUBio, aby uzyskać pożądane dane wyjściowe, takie jak podstawowy adres URL etykiet, styl, czcionka, rozmiar itp. Pozwala także użytkownikom wybrać wzrost drzewa i pozycję węzła, aby nadać mu dobry wygląd.
Narzędzie online zajmuje się kilkoma rzeczami, takimi jak Stawonogi, DroSpeGe, enGenes, wFleaBase i wiele innych. Oferuje publiczny dostęp użytkownikom z bioinformatyki i biologii molekularnej. IUBio obejmuje genom Drosophila, analizę sekwencji, konwersje sekwencji biologicznej i edytory do dowolnego zastosowania.
Wniosek
Twórcy kladogramów z drzew pozwalają na przedstawienie linii ewolucyjnych z rozgałęzieniami i liczbą zmian genetycznych dla podstawień nukleotydów. Łatwo jest również reprezentować podstacje na podstawie % zmian w sekwencji.
Oprócz tego należy zachować strukturę drzewa, skupiając się na gałęziach i węzłach (węzły wewnętrzne i zewnętrzne – liście i końcówki). Schemat zawiera również zegar molekularny, który pozwala określić ostatecznych wspólnych przodków.
Zacznij od znacznika kladogramu, aby uzyskać pożądane rezultaty.